吉林大学第二医院有三个院区，其中自强院区位于吉林省长春市南关区自强街218号，始建于1936年11月，占地面积17.1万平方米，建筑面积43.9万平方米，是一所集医疗、教学、科研、康复、保健于一体的三级甲等综合性医院，是吉林省、长春市医保和新农合定点医院，是吉林省乃至东北地区疑难和危重疾病的诊疗中心，是国家级住院医师规范化培训基地、卫生部先心病介入诊疗培训基地，先后荣获国家爱婴医院、全国百姓放心示范医院、全国五一巾帼标兵岗、创建国家卫生城市工作先进单位、吉林省优质护理服务示范医院等荣誉称号。